Илиянският манастир е основан в края на ХVІ и началото на ХVІІ век. От него е оцеляла само източната част на сегашната църква. Първоначалната украса на църквата е от същия период. В този период са създадени стенописите в църквите от цялата Софийска област. Стилово и тематично те приличат на украсата в Куриловския, Сеславския, Елешнишкия и други манастири и са свързани с творчеството и влиянието на Пимен Зограф.

В Илиянския манастир има три периода в изписването на църквата. Първият период е свързан с нейното построяване, вторият и третия период с нейното разширяване в края на ХVІІ и през ХІХ век. Първоначалната стенописна украса е замазана с вар и за нея съдим от малкото, което е разчистено. Третият период в украсата е през 1832 година, което се разбира от надписа в църквата. За най-вероятен художник се сочи Тома Вишанов от Банската школа. Той е автор на украсата на църквата "Покров Богородичен" в Рилския манастир. В стенописите от 1832 година личи стремеж към реалистично представяне на фигурите и предметите, но има изсушаване на колорита.