Aвторите на тези страници са разделили защитените територии на две основни групи. В Първата група влизат по-слабо защитени природни обекти класифицирани съгласно законодателството на Република България като природни забележителности и защитени местности и Втората група, като природни обекти за които държавата полага по-строги мерки за защита и грижи за опазването им - природни паркове и резервати. Природните забележителности и защитени местности са описани по области - област Ямбол, област Сливен, област Бургас, поради големия им брой и да бъдат по-лесно откриваеми за читателите.

Природните паркове и резерватите са по-малко на брой и са описани самостоятелно, с подробна информация за биоразнобразието в тях. На територията на Южен източен район се намират природените паркове Странджа и Сините камъни. Авторите на този сайт са сметнали за необходимо да дадат и обща информация за Сакар планина, Манастирските и Дервентските възвишения.

Данните за защитените територии са взети от Министерство на водите и околната среда. Снимки от защитените територии можете да видите във фотогалерията - Защитени територии.